生殖器疱疹若长期反复发作或未规范治疗，易引发多种并发症，严重威胁身心健康。局部常见并发症为继发感染，疱疹破溃后细菌侵入，会导致患处红肿、化脓、疼痛加剧，还可能遗留疤痕或色素沉着，破坏生殖部位黏膜组织。
全身层面，病毒可能侵入神经系统，引发疱疹性脑膜炎、神经根炎等，出现头痛、呕吐、肢体麻木、抽搐等症状，严重时危及生命；还可能诱发盆腔炎、前列腺炎等生殖系统炎症，影响生殖功能。对特殊人群而言，孕妇感染后可能导致胎儿发育畸形、早产、流产，分娩时病毒易传染新生儿，引发新生儿疱疹，出现皮肤黏膜疱疹、肺炎、脑炎等，死亡率较高。
此外，生殖器疱疹还会增加感染艾滋病等其他性传播疾病的风险，因患处黏膜破损会为病毒入侵提供便利。因此，确诊后需及时规范治疗，降低并发症发生概率。
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