急性骨髓炎的感染病菌种类与患者年龄、感染途径密切相关，其中金黄色葡萄球菌是临床最常见的致病菌，占成人及儿童病例的50%以上。
金黄色葡萄球菌毒力较强，可通过血液传播、开放性伤口直接入侵或邻近组织感染蔓延等途径侵入骨髓，快速引发骨质炎症与破坏。儿童群体中，除金黄色葡萄球菌外，溶血性链球菌也是常见致病菌，多因呼吸道、皮肤等部位的感染灶经血行播散至骨骺端所致。
此外，新生儿急性骨髓炎可能由大肠杆菌、B族链球菌引发；有外伤或手术史的患者，还可能出现铜绿假单胞菌、厌氧菌等混合感染。明确致病菌是选择抗生素、制定治疗方案的关键，需通过血液或骨组织培养精准判断。
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