肝恶性肿瘤（以原发性肝癌为主）的发病是多因素、多阶段作用的结果，核心诱因与肝脏长期受损及不良因素累积密切相关。
最关键的是病毒性肝炎感染，乙肝病毒（HBV）和丙肝病毒（HCV）慢性感染会持续破坏肝细胞，引发肝纤维化、肝硬化，最终诱发癌变，这是我国肝恶性肿瘤最主要的病因。其次是肝硬化，无论由肝炎、酒精性肝病还是非酒精性脂肪肝引起，肝硬化患者患肝癌的风险都会显著升高。
此外，不良生活习惯不容忽视：长期大量饮酒会导致酒精性肝病，逐步发展为肝癌；食用被黄曲霉素污染的食物（如霉变花生、玉米），其毒素会直接损伤肝细胞DNA，诱发突变；糖尿病、肥胖导致的非酒精性脂肪肝，也已成为近年肝恶性肿瘤的重要诱因。
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