流产的发生多与胚胎、母体、环境等因素相关，常见原因主要有三类。
首先是胚胎自身因素，这是早期流产最主要的原因。若胚胎染色体数目或结构异常，会导致胚胎发育不良，无法正常着床或继续生长，约占早期流产的50%-60%，这种情况多为自然淘汰的过程。
其次是母体因素。母体患有全身性疾病，如严重感染、高血压、糖尿病等，会影响胚胎供血和发育；子宫结构异常，如子宫肌瘤、子宫畸形、宫腔粘连等，会破坏胚胎生长环境；内分泌失调，如孕酮不足、甲状腺功能异常，也会导致胚胎着床不稳；此外，孕期过度劳累、情绪剧烈波动、腹部受到撞击等，也可能诱发流产。
最后是环境因素，孕期长期接触甲醛、苯、辐射等有害物质，或吸烟、酗酒、接触二手烟，会损害胚胎细胞，增加流产风险。
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