复发性流产指连续发生3次及3次以上的自然流产，其原因复杂多样。胚胎染色体异常是首要因素，约半数以上的复发性流产由此导致，染色体数目或结构的畸变，使胚胎难以正常发育，引发流产。
母体因素也不容忽视。子宫结构异常，如单角子宫、纵隔子宫、子宫黏膜下肌瘤等，会影响胚胎着床与发育；内分泌失调，如黄体功能不全、甲状腺功能异常、多囊卵巢综合征等，无法为胚胎提供适宜的生长环境；免疫系统紊乱，母体将胚胎视为异物进行攻击，同样会造成流产。此外，生殖道感染，如沙眼衣原体、支原体感染，炎症波及宫腔，也可能引发复发性流产。
环境因素方面，长期接触铅、汞等有毒化学物质，或处于高辐射环境，以及不良生活习惯，如吸烟、酗酒、吸毒等，都可能增加复发性流产的风险。
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