肛门脓肿是肛肠科常见病症，其形成主要与感染和自身机体状态相关。
肛腺感染是肛门脓肿的主要诱因。肛门腺开口于肛窦，当粪便残渣、细菌等堵塞肛窦，引发肛腺炎症，炎症会沿着肛腺导管扩散至肛周组织，形成脓肿。此外，直肠周围的组织间隙本就疏松，一旦细菌侵入，就容易繁殖蔓延，加重感染程度。
不良生活习惯也会增加患病风险。长期便秘或腹泻，会破坏肛门局部的生理环境，使细菌更容易滋生；久坐不动、饮食过于辛辣油腻，会影响肛周血液循环，降低局部组织抵抗力，促使肛门脓肿发生。另外，糖尿病、免疫力低下等全身性疾病患者，因身体抗感染能力减弱，也比常人更易患上肛门脓肿。
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