肛瘘多由肛周脓肿发展而来。当肛腺感染化脓后，脓肿自行破溃或切开引流，脓腔逐渐缩小，但肛门皮肤破口和内口之间形成的管道难以愈合，就会演变成肛瘘。此外，不良生活习惯也是诱因，长期便秘或腹泻会反复刺激肛门，损伤肛管皮肤，为细菌入侵创造条件;久坐、缺乏运动导致肛周血液循环不畅，降低局部抵抗力，也易引发感染。
结核、溃疡性结肠炎、克罗恩病等全身性疾病，会削弱机体免疫力，使肛门部位更易受病菌侵袭，诱发肛瘘。直肠肛管外伤后处理不当，细菌从伤口侵入，同样可能引发肛瘘。一旦发现肛瘘相关症状，如肛门反复流脓、肿痛，应及时就医，避免病情加重。
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