便秘由多因素导致。饮食结构失衡是主因，如低纤维饮食、饮水不足，肠道缺乏刺激易致蠕动减慢。缺乏运动会降低胃肠动力，尤其久坐人群更易发病。不良排便习惯(如抑制便意、排便时间不规律)可削弱直肠敏感性。疾病因素包括肠道病变(如肠梗阻、巨结肠)、内分泌紊乱(如甲状腺功能减退)及神经精神疾病(如抑郁症)。药物影响(如抗抑郁药、钙剂)也可能抑制肠道蠕动。此外，衰老导致腹肌及肠壁平滑肌张力下降，妊娠子宫压迫肠道等，均可能引发便秘。
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