甲状腺癌的发病受多种因素综合影响。放射性接触是重要诱因，尤其是儿童时期，若头颈部接受过放疗，甲状腺细胞易受辐射损伤，发生基因突变，进而增加患癌风险，如切尔诺贝利核事故后，周边地区甲状腺癌发病率显著上升。
遗传因素也不容忽视，约 5%-10% 的甲状腺癌具有遗传性。如果家族中有甲状腺癌患者，个体携带特定基因突变的几率较高，像 RET 基因突变，就与髓样甲状腺癌密切相关。
此外，激素水平失衡也可能引发甲状腺癌。甲状腺受体内促甲状腺激素(TSH)调节，长期 TSH 水平异常升高，会刺激甲状腺细胞过度增生，增加癌变可能性。另外，碘摄入异常，无论是碘缺乏还是过量，都可能干扰甲状腺正常功能，一定程度上促使甲状腺癌发生。
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