疱疹性咽峡炎主要由肠道病毒引起，其中柯萨奇病毒 A 组最为常见。这些病毒生命力顽强，在人群中广泛传播。
传播途径多样，主要通过粪 - 口途径传播，如接触被病毒污染的物品后，未经洗手便触摸口鼻，病毒由此进入人体。也可经呼吸道飞沫传播，当感染病毒的患者咳嗽、打喷嚏时，周围人吸入带有病毒的飞沫就可能被感染。
个人因素也会影响发病几率。儿童由于免疫系统尚未发育完善，尤其是婴幼儿，更易成为病毒的侵袭目标。在集体生活环境中，如幼儿园、学校，人员密集，一旦有一人感染，病毒便极易在人群中扩散。此外，卫生习惯差、身体抵抗力低的人群，感染疱疹性咽峡炎的风险也更高。了解这些病因，有助于做好预防工作。
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